Đồng(II) điphosphat là chất rắn màu xanh lam nhạt, có mùi đặc trưng, thực tế không tan trong nước.

Hai cấu trúc tinh thể đơn nghiêng của đồng(II) điphosphat đã được biết đến. Qua đó, những thay đổi thuộc tính cho thấy quá trình chuyển đổi từ pha α với nhóm không gian C2/c sang β với nhóm không gian C2/m cho đến sự xuất hiện của pha trung gian tiếp theo trong khoảng nhiệt độ 347–363 K.[6]